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全内反射瞬逝场照明高精度磁镊及其在DNA解旋酶研究中的应用

王爽 郑海子 赵振业 陆越 徐春华

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全内反射瞬逝场照明高精度磁镊及其在DNA解旋酶研究中的应用

王爽, 郑海子, 赵振业, 陆越, 徐春华

A pair of high resolution magnetic tweezers with illumination of total reflection evanescent field and its application in the study of DNA helicases

Wang Shuang, Zheng Hai-Zi, Zhao Zhen-Ye, Lu Yue, Xu Chun-Hua
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  • 传统磁镊的测量精度受限于磁球的布朗涨落, 当磁力小于约10 pN时, 磁球的布朗涨落明显增大, 对应磁镊的空间分辨率显著下降. 为了提高传统磁镊在小力条件下的测量精度, 本文将全内反射荧光技术引入到磁镊技术中, 并建立相适应的磁球-手柄-荧光微球-待测生物分子单分子连接系统, 在小力条件下(小于10 pN)获得纳米量级的测量精度. 应用改进的磁镊对DNA发卡的折叠-去折叠态的转变过程进行了研究, 依据DNA发卡的折叠-去折叠态转变的性质对全内反射场的穿透深度进行了校正, 并结合实验结果对改进后的磁镊的测量精度进行分析. 观察了Bloom解旋酶的解旋动力学过程, 获得初步实验结果, 证实了改进的磁镊在单分子研究中的实用性.
    The resolution of conventional magnetic tweezers is limited by the Brown motion of magnetic beads. When the force is lower than ~10 pN, the resolution of magnetic tweezers decreases significantly because of the increased Brown motion. To improve the resolution of magnetic tweezers under low forces, we combine the total internal reflection fluorescence techniques with magnetic tweezers, and design a novel single molecule connection: magnetic bead-DNA linker-fluorescent bead-single molecule. With the improved magnetic tweezers, we study the folding dynamics of a DNA hairpin. The results reveal that a nanometer-scale resolution is obtained. By analyzing these results, we calibrate the penetration depth of the total internal reflection field. Finally, we investigate the unwinding dynamics of a BLM helicase core protein. Some preliminary results of the helicase unwinding experiments confirm the practicability of the improved magnetic tweezers in the field of single molecular research.
    • 基金项目: 国家自然科学基金(批准号: 61275192, 11004234)和国家高技术研究发展计划(批准号: 2012AA02A104)资助的课题.
    • Funds: Project supported by the National Natural Science Foundation of China (Grant Nos. 61275192, 11004234) and the National High Technology Research and Development Program of China (Grant No. 2012AA02A104).
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出版历程
  • 收稿日期:  2013-04-03
  • 修回日期:  2013-04-15
  • 刊出日期:  2013-08-05

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